因为从前云深仅用神力制造系统，所以时空管理局里，至今只有三个系统。 一个云泽，一个云浮，还有一个，因不满小三这个名字，而被云泽改名的云沉。 也是因此，时空管理局可谓是事多人少。 为了增加劳动力，祁星尝试用程序代码制造系统，然后赋予每一个系统足够自我成长的神力。 渐渐的，时空管理局里从只有三个系统存在，变成了有成千上万的系统。 同时，为了合理分配系统们的工作，祁星还将时空管理局细分成了许多部门。 比如负责修复任务的修复部，负责收集任务的收集部，以及负责修正任务的修正部，等等。 总之，由不同的部门负责不同的任务，以便不同类型的系统们自主选择更适合自己的工作。 后来，由于低级系统难以独立完成任务，祁星又开始从三千小世界里选取合适的灵魂与系统自愿绑定。 有了宿主的帮助，低级系统完成任务的效率都高了许多，升级速度也变快了。 为了筛选合适的宿主，祁星还制定了一套考核标准，只有完成考核，才能正式成为时空管理局的员工。 否则，就只能和系统临时绑定，无法长期绑定。 而对于时空管理局的员工们，祁星也制定了详细的规则。 那就是开通系统商城，完成任务的员工，可以得到积分，积分可以兑换系统商城里的道具。 经过不断的尝试与完善，时空管理局终于有了一套自我运作流程。 那便是由不同部门的系统去各个世界寻找合适的宿主，完成不同类型的任务，以此维护宇宙时空稳定。 在这套流程下，就算祁星这个主神不在时空管理局坐镇，也不会有什么影响。 何况时空管理局还有云泽和云浮在看着。 处理好时空管理局的事后，祁星就准备去找云深了。 但此时的云深，因为神力的消散，已经逐渐失去了过往的记忆。 又因为分散了本源之力，导致神魂十分虚弱。 如果祁星直接将神力灌注给云深，云深的神魂很可能会因为承受不住磅礴的神力而消散。 祁星没办法，只能分散了自己的神魂去小世界里寻找云深的本源之力，同时让3号去绑定云深，引导云深收回自己的本源之力。 因为云深没了记忆，怕云深不愿意与3号绑定，所以在3号去之前，云泽抽取了他的一段记忆，并植入了一段虚假的记忆。 3号系统就此成为了系统333。 虽然中途因为这个差点出现了意外，但好在最后还是阴差阳错的绑定了云深。 只是祁星没想到，没了记忆的云深竟然爱上了他。 在得到了云深的爱之后，祁星的初衷也逐渐变了。 从帮助云深找回本源之力，变成了和云深谈恋爱。 甚至于后来怕云深恢复记忆后会再次不要他，所以不停的分裂自己的神魂，让云深只能留在小世界里寻找他的灵魂碎片。 好在云深恢复记忆后并没有打算再次离开，祁星这才放心与云深一同回归。
