时光飞逝，转眼，祁星已经从只有云深膝盖高，长到比云深还高了。 云深的神力也一点点转移到了祁星身上。 但这件事只有云深知道，祁星不知道，云泽和云浮也不知道。 他们只知道云深变得越来越懒，越来越嗜睡，每天几乎除了睡，什么都不干。 祁星虽然不想做主神，但为了让云深能安心撂挑子，还是接手了时空管理局的事务。 如今，祁星每天除了处理时空管理局的事，就是守在云深身边。 祁星眼里的爱意也已然到了藏不住的地步，云深知道，却只能装不知道。 他和祁星之间是此消彼长的关系，或者说，是消失与诞生的关系。 世间只能有一位主神，在他完全消失的那一天，就是祁星真正成神的那一天。 若他不消失，那祁星就会消失。 他们注定是走不到一起的。 云深知道以祁星对自己的感情，若是知道一切真相，只怕宁愿舍弃自己，也不会让他消失。 所以云深在神力完全消失前，将主神之位交到了祁星手里。 从此，时空管理局由初代主神掌管，正式变为由二代主神掌管。 交接完主神之位后，云深便开始计划着在自己神力彻底消失前躲起来，否则就瞒不住祁星了。 祁星本以为主神之位不过是担任个名头，云深不想要，要送给他，那他就接着，如果云深想要回去，那他也会随时归还。 反正他永远都不会拒绝云深。 直到有一天，云深突然消失了，只留下一个名为小三的3号系统，以及一句话。 云深说自己想去四处游历，让他们不必寻他，管好时空管理局。 祁星自然不可能不去找云深，他疯了般找遍了宇宙所有地方，但始终没有云深的踪迹。 直到云泽提出，云深可能是藏进了三千小世界里。 云深是三千小世界的创造者，如果他藏身于三千小世界，那便如同水入江海，了无痕迹。 祁星由此探查一番，果真发现了线索。 虽然确定了云深就藏在三千小世界里，但祁星还是找不到他。 因为云深将自己的本源之力，分散到了小世界里许多名为云深的人身上，干扰了祁星。 不过，世上无难事，只怕有心人，纵然云深设置了重重障碍，祁星还是找到了云深。 正当祁星准备去小世界里找回云深的时候，那道指引他等待云深的声音再次出现了。 那道声音正是宇宙法则的化身。 宇宙法则向祁星言明，他与云深是无法共存的关系，如果祁星找回了云深，那么他将代替云深逐渐消失于宇宙中。 祁星宁愿自己消失，也不愿云深消失，执意要去找回云深。 宇宙法则最终妥协，同意了祁星去找云深，代价是他永生无法成神，他与云深共享神力，两人皆降为半神。 但宇宙法则还有一个条件。 那就是，在祁星去找云深之前，祁星必须保证时空管理局就算没有了主神管理，也能独立运行。 自此，祁星开始对时空管理局进行了一场大变革。
