若要根治这1问题，就要从两方面入手，第1是严格管束军队，严肃风纪，严禁有扰民害民之事发生。
第2就是加强军队宣传，制定针对军属的优待政策，鼓励宣传民众参军，灌输“1人当兵，全家光荣”的思想，并在各级学堂设立兵操等军事训练项目，用以充当体育教育。
于此同时，军队数量也要进行扩充，并对现有编制进行调整。
到1895年7月战争结束，东南6军总共拥有7个步兵师，4个混成旅和1个骑兵师，共计136万人。这些人中有4个师和1个混成旅是在战时扩充的，除此之外还有楚军等半近代军队，这些军队都是需要改造的，整编之后就是很好的军队。
因此，在整军计划中，6军将在该基础上增设两个步兵师、3个骑兵师、1个混成旅和1个教导总队。
增设教导总队是左念微深思熟虑过后的结果，在新式教育中，最先铺开的就是军校和技校，尤其是海军方面，至今已有近3十年的发展历史，而6军学校也有了十多年的发展历史。
没有好的军校是练不好兵，这是1条铁律，因此左念微在原有的船政6军、海军学堂和江南6军、海军学堂的基础上，设立了江宁、安庆、徐州3大6军士官学校，江宁、厦门两大海军士官学校，同时在江宁设立东南6海军事大学。
这些学校即将毕业的学生也要进入教导总队历练，教导总队就是6军之标杆，是1座会移动的军校。
教导总队的规模也相当大，下辖3个步兵旅，1个骑兵团，1个炮兵团，1个搜索营，1个工兵营，1个通讯营，1个辎重营。
炮兵团下辖2个炮兵营和1个重炮兵营，拥有36门75山炮和18门150重炮。
步兵旅下辖3个步兵团，1个旅属炮兵营，拥有18门75山炮。
步兵团下辖3个步兵营，重迫击炮加强连、重机枪加强连、工兵连、辎重连、通信连、特务连、卫生队各1，拥有150重迫击炮8门、马克沁重机枪4挺。
步兵营下辖3个步兵连，1个重机枪连，1个迫击炮连，1个步兵炮连，拥有马克沁重机枪2挺、60迫击炮4门，90迫击炮4门、75山炮1门。
步兵连下辖3个步兵排，1个迫击炮班，拥有2门60迫击炮。
步兵排下辖3个步兵班，1个掷弹筒班，拥有2具50掷弹筒，步兵班14人。
教导总队总共编有3万余人，装备有步、骑枪15000支，50掷弹筒486具，60迫击炮270门，90迫击炮108门，150迫击炮72门，马克沁重机枪90挺，75山炮117门，150重榴弹炮18门。
这支标杆军队将会由左念微亲自统帅，未来的大战也1定会有他们的身影。
除了编制、人员改动，6军其他方面的主要变动就是增加了火炮和机枪数量（以步兵师为单位计）：
光绪十8年式马克沁重机枪增至48挺；
50、60、90迫击炮分别增至188门、64、48门，增设新研制成功的光绪2十年式150重迫击炮24门；
光绪十4年式仿克虏伯75山炮增至64门，增设师部直属重炮兵营6门150克虏伯重炮；
同时设立3个独立重炮兵团，每团下辖3个重炮营，每营下辖3个连，每连4门150克虏伯重炮，每团计3十6门，总计1百08门。
设立5个攻城重炮兵团，每团下辖3个重炮营，每营下辖3个连，每连两门210攻城臼炮，每团计十8门，总计9十门。
除此之外，还有1种新兵种加入了东南6军，那就是装甲列车，徐州兵工厂已经生产了两列装甲列车，并通过了试验，后续按照计划将增设30—50列，建立多支装甲列车队。
这次6军整军计划预计用时5年，耗费6600万元，经过整编之后，6军人数将达到23万，装备齐全，战斗力绝对是亚洲第1。
在这5年内，东南巡阅府将会逐步完成6军以及6军司的各项建设，为未来的光复中华的伟大行动提供强有力的支撑。
当然，虽说目标很宏大，但从短期来看，6军更有可能的是投入大量的频繁的低烈度战争中，这对于6军来说自然不是1件好事。
所以其他6地武装力量的建设就显得尤为重要，首先就是东南辖区内的武装警察力量，按照公安署的计划，5年内将要建设1支10万人的武警部队，建设1支20万人的警察部队，用以保卫东南百姓的安全。
其次，还有1种队5也很重要，那就是保路总队，东南巡阅府拥有山东和东3省的筑路权、使用权、所有权等，建设这些铁路时，东南也会顺带着建立1支保安团队，这支团队的规模取决于铁路建设情况，但毫无疑问的是，这部分人会非常多，多到足以在短时间击败几个省的1般军事力量，并有效弹压地面。
东南自保从来不是偏安1隅，左念微会抓住1切向外扩张的机会，尽可能快的统1全国，并最大程度保存国家元气。
