得到天下后，祝巨经过深思熟虑，最终决定在南方的建康城举行登基大典，并册立他那十几岁的儿子祝听涛为太子。 然而，祝巨心里明白，建康城并非他心目中最理想的建都之地。 之所以选择在这里，仅仅是因为这里的宫殿相对较为完整，而在刚刚立国之际，不宜大规模兴建土木工程，只能暂且将就。 根据羽源田精心考证的较为规范的开国皇帝登基仪式，首先需要昭告天下，让各地的世家大族纷纷上书。 接着大臣们还要五次劝进，而皇帝本人则需五次明确拒绝，说自己功不足德不够，不配称皇帝。 只有在大臣们的一再恳切请求下，方可正式使用帝号。 此外，还需要撰写青词向天、地、人三界禀告。 就此祝巨，出现复兴了天命王朝，史称后天命，以区别百国血雨之前的那个天命王朝。 祝巨早年曾是绿林好汉出身，对贪污腐败行为深恶痛绝。 因此，他制定了严厉的法律规定：凡贪污金额超过二十两者，一律斩首；超过五十两者，则要扒皮萱草，并将尸体悬挂于城隍庙门口示众。 若贪污金额超过八十两，不仅当事人要被处死，其全家老小也要被问斩；若贪污金额超过一百两，更是要诛灭其三族。 若是贪污金额超过五百两，就要灭掉其六族；至于贪污金额达到一千两者，直接诛灭九族。 不过祝巨文化程度不高，虽然已经贵为皇帝，但对于很多事情仍感到棘手，因此除了和大臣们一起集思广益之外，他还会与妻子洛锦英商量。 然而，在这个时代，有一个不成文的规矩：后宫不得干预朝政。但这条规矩在祝巨这里并不存在。 祝巨认为，皇帝的后宫只要能帮助繁育子嗣就行，不需要过多的人数。 于是，他规定皇帝的后宫只需设立一名皇后、三位贵妃以及五位才人便已足够。 由于后宫人数不多，通常情况下，无论是选立皇后还是册封贵妃及才人，皇帝都会谨慎行事。 然而，登基仅仅五年后，便有人向祝巨禀报：“北方的狼族也结束了内乱，无敌可汗统一了草原，并建立了突蒙丹喀汗国。现在他们正南下，企图劫掠我们的天命王朝！” 听到这个消息，祝巨怒不可遏。他深知，必须采取行动，让北方的狼族明白，他们的天命王朝绝不好惹。 正所谓“打得一拳开，免得百拳来”，他决心给这些北方狼族一个教训，让他们不敢轻易侵犯自己的国家。 于是祝巨拎起来，自己那一百二十斤的斩马刀，就带人御驾亲征了。 这一战十分传奇，混战中双方的首领遇到了，结果这位天命王朝的皇帝祝巨，居然用刀劈死了对面的无敌可汗。 这让无敌可汗，这个狂妄自大的称呼变成了笑话。 关键问题是突蒙丹喀汗国，信奉强者为王，所以无敌可汗死后，很长一段时间都没有再进犯天命王朝。 后来博尔济吉特家族的一个将军，夺得汗位，也就是御龙可汗。 但是这位可汗仰慕中土风物，在突蒙丹喀设立六部和文官之首太师的位置，并且要求和天命王朝的皇室结亲。
